流式抗體的選擇：

1 流式抗體本身也是抗體，所以選擇流式抗體一定要滿足抗體選擇較基本的條件：目標(biāo)蛋白特異性，反應(yīng)種屬以及應(yīng)用實驗。

2 流式抗體熒光標(biāo)記的方式包括直接標(biāo)記和間接標(biāo)記兩種。在流式實驗過程中，盡量減少實驗工序和過程，以保證實驗的真實和準(zhǔn)確性。因此在條件允許的范圍內(nèi)，建議盡量用直接標(biāo)記的抗體進(jìn)行實驗而不去做間接標(biāo)記。

3 流式抗體熒光標(biāo)記的選擇：如果實驗中檢測單一指標(biāo)：不同熒光標(biāo)記在不同的儀器上強(qiáng)度不同。FACS Calibur儀器為例：PE ＞APC ＞PE-Cy5 ＞PerCP ＞FITC ＞PerCP-Cy5.5，通常來說，PE較強(qiáng)，適用于弱表達(dá)抗原。FITC強(qiáng)度較弱，適用于強(qiáng)表達(dá)抗原，使用范圍比較廣。用戶需根據(jù)檢測的目標(biāo)蛋白進(jìn)行具體選擇。如果同時檢測多個指標(biāo)：確認(rèn)流式細(xì)胞儀能檢測多少個通道：流式抗體每個通道只能選擇1種熒光素。各個通道之間的熒光素可以隨意搭配。

如：實驗者同時檢測三個指標(biāo)，可以在圖1中綠色、黃色和紅色三個通道中各選一個適當(dāng)?shù)臒晒馑貥?biāo)記，F(xiàn)ITC、PE和PE-cy5。切忌所有指標(biāo)選擇同一個通道的熒光標(biāo)記，以防止熒光的重疊和相互干擾，影響較后結(jié)果。因此，流式細(xì)胞儀的通道越多，同一份樣本能同時做的表面/胞內(nèi)標(biāo)志就越多。常用熒光標(biāo)記包括FITC, PE, PEcy5, PEcy5.5, APC等。

同型對照的選擇：

流式細(xì)胞實驗和其他抗體相關(guān)實驗有點(diǎn)不同的就是需要選擇同型對照。同型對照，是用于消除由于抗體非特異性結(jié)合到細(xì)胞表面而產(chǎn)生的背景染色，相當(dāng)于實驗的陰性對照。同型對照選擇與標(biāo)記抗體同種屬來源，同亞型，同熒光標(biāo)記的抗體。比如：抗人的CD3的PE標(biāo)記的抗體，小鼠的IgG2a。同型對照選擇PE標(biāo)記的小鼠的IgG2a。