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常見PCR類型簡述
常見PCR類型簡述:
1、常規(guī)PCR:
直接PCR是指直接從樣品擴(kuò)增目標(biāo)DNA,無需進(jìn)行核酸分離純化。
2、熱啟動(dòng)PCR:
熱啟動(dòng)PCR常用于增強(qiáng)PCR擴(kuò)增的特異性。該方法主要利用抗體、親合配體、適體或化學(xué)修飾物等酶修飾酶,來抑制室溫下的DNA聚合酶的活性。這種修飾使得在PCR體系配制階段引物與模板、引物與引物之前的結(jié)合能力降低,從而避免了非特異性擴(kuò)增。
3、巢式PCR:
巢式PCR是標(biāo)準(zhǔn)PCR的一種演變,其增強(qiáng)了反應(yīng)特異性和目標(biāo)擴(kuò)增子的產(chǎn)量。
4、快速PCR:
在快速PCR中,通過縮減PCR步驟所需時(shí)間來完成更快的擴(kuò)增,且不會(huì)影響擴(kuò)增產(chǎn)量和效率??焖傺h(huán)條件尤其適用于具有高擴(kuò)增能力的DNA聚合酶,這類聚合酶在每個(gè)結(jié)合中可引入更多的核苷酸。
5、高GC含量PCR:
具有高GC含量(>65%)的DNA模板由于G和C堿基間的強(qiáng)氫鍵影響,比較難以擴(kuò)增。富含GC的序列同時(shí)也涉及二級結(jié)構(gòu)。因此,富含GC的序列可導(dǎo)致DNA聚合酶沿模板擴(kuò)增時(shí)“卡頓”并干擾DNA合成。
6、多重 PCR:
多重PCR可在同一PCR反應(yīng)管中同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)不同的片段。多種PCR不僅意味著節(jié)省時(shí)間、試劑和樣品,還能夠同時(shí)對比多個(gè)擴(kuò)增子
7、長片段 PCR:
長片段PCR通常是指擴(kuò)增大于5kb的DNA片段。長片段PCR傳統(tǒng)上使用 Taq DNA 聚合酶(用于快速延伸)和高保真酶(用于提高準(zhǔn)確性)的混合物。
8、定量PCR:
序列的擴(kuò)增程度(得率)取決于模板起始量,PCR常用于對樣品中的DNA進(jìn)行定量,其中,常見的應(yīng)用是 基因表達(dá)定量。