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PCR試劑盒實驗步驟:
?準備階段?:
戈氏放線菌探針法熒光定量PCR在PCR管上做好標記,并將其置于冰上或低溫金屬塊上。
按照所使用的PCR酶說明書上的體系配制反應預混液。這是一種具有高特異性及優(yōu)良擴增性的高保真DNA聚合酶,適用于簡單或復雜模板、短片段或長片段的PCR擴增,并添加了單克隆抗體以在常溫條件下抑制DNA polymerase活性,允許在常溫下配制預混液。
配制反應液時,按照順序添加RNase free water、10×PCR Buffer、dNTP Mix、引物,后加入DNA聚合酶。注意模板需在模板區(qū)加入。
預變性處理?:
將待檢測的DNA樣品與緩沖液混合,加入引物和dNTPs,然后在適當?shù)臏囟认逻M行預變性處理,使DNA雙鏈解開。
PCR循環(huán)?:
加入DNA聚合酶和熒光染料,在變性、復性、延伸的溫度循環(huán)中完成DNA的擴增。
通過熒光信號的讀取和分析,得出待檢測DNA樣品的濃度和序列信息。
結果分析?:
PCR技術具有高靈敏度、高特異性和高分辨率等優(yōu)點,能夠檢測出微量的DNA,并準確地檢測出DNA序列的變異和突變。
結果分析方法包括定量和相對定量,根據(jù)實驗需求選擇合適的方法進行分析。
整個實驗過程中,需要注意試劑的配制順序、酶的使用條件、模板的添加量以及引物的濃度,以確保實驗的準確性和可重復性。此外,實驗設計階段需要充分考慮實驗原理、操作流程、設備和試劑的選擇,以及實驗記錄的詳細性,這些都是保證實驗成功和結果可靠的關鍵因素?。
商品貨號
PR6700
英文名稱
Actinomyces gerencseriae
商品名稱
戈氏放線菌
產品分類
熒光定量PCR
規(guī)格
50T
包裝
盒裝
用途
僅供科研研究實驗
保存
-20℃避光
實驗流程:
1. 配制PCR反應體系:
- 模板DNA:10-100 ng(取決于模板的復雜性和豐度)
- 引物F(正向):0.1-1.0 μM
- 引物R(反向):0.1-1.0 μM
- dNTPs(混合的dATP、dCTP、dGTP、dTTP):0.2 mM each
- 10×PCR緩沖液:1×
- MgCl2:1.5-2.5 mM(根據(jù)酶的要求調整)
- DNA聚合酶:0.5-2.5 U(根據(jù)酶的活性調整)
- 無菌去離子水:補足至總體積(通常為20-50 μL)
2. 設置PCR程序:
- 初始變性:95°C,3-5分鐘(激活聚合酶)
- 變性:95°C,15-30秒(每個循環(huán))
- 退火:50-65°C,15-30秒(根據(jù)引物Tm調整)
- 延伸:72°C,30-60秒/kb(根據(jù)目標片段長度調整)
- 終延伸:72°C,5-10分鐘
- 保存:4°C
3. 執(zhí)行PCR:
- 將配制好的反應體系放入PCR儀器中,啟動程序。
4. 電泳分析:
- PCR結束后,取少量反應液進行1%瓊脂糖凝膠電泳,以驗證擴增效果。
5. 結果判斷:
- 觀察電泳結果,目標條帶應清晰可見,無非特異性擴增。
PCR操作流程及注意事項:
一、試劑準備階段
試劑準備是 PCR 操作的個流程,需要在試劑貯存和準備區(qū)的超凈工作臺或生物柜進行,用確保無污染的移液器、槍頭及容器等進行分裝。所有的 PCR 體系都應該在 - 20℃ 保存,除了 ddH2O 之外,其余的試劑組份需完全融化之后再加入,以免影響濃度。配制反應體系應在快速進行,以減少非特異性擴增。體系配制完成之后應馬上進行 PCR 反應。
二、樣本制備階段
樣本制備是整個 PCR 反應中為關鍵的環(huán)節(jié),在接收樣本時一定要確保樣本的密封性以及樣本編號的性。嚴格遵守操作規(guī)程進行加樣操作,操作時候盡量少說話或者不說話。所有操作需要在生物柜內進行,操作前后生物柜需要進行紫外燈,注意生物柜中物品的排放。戴手套并勤于更換,要有「無核酸觀念」 。
三、核酸擴增
在核酸擴增環(huán)節(jié)需要選擇質量好的 Ep 管,裝入反應體系的 EP 管上機前混勻、離心,將管壁及管蓋上的液體甩至管底部。在樣本檢測的同時設立對照(陽性對照、陰性對照、陰性模板、試劑對照)。同時嚴密檢測 PCR 擴增儀的各項性能指標,其中對 PCR 擴增儀而言溫度控制就意味著質量。
四、產物分析
常見問題:
1)無 CT 值出現(xiàn):模板量不足(雜質的引入及反復凍融的情況等)
2)CT 值出現(xiàn)過晚(大于 38):各種反應成分的降解或加樣量的不足
3)標準曲線線性相關性不佳:加樣誤差、標準品出現(xiàn)降解等
4)陰性對照有信號:模板有基因組的污染
5)擴增效率低:反應試劑中部分成分特別是熒光染料降解、反應抑制
6)擴增曲線的異常:模板的濃度太高或熒光染料的降解
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